Philémon rêve du jour où il deviendra un grand scientifique et changera le monde avec ses découvertes. En attendant, il ne manque jamais une occasion de faire des expériences et note minutieusement ses observations dans un petit carnet bleu. Ceci en étant convaincu qu'il n'a aucun atome crochu avec Lili, sa voisine, qui est quant à elle passionnée par les arts plastiques et ne cesse de griffonner dans le cahier noir qu'elle traîne partout. Et pourtant, les deux enfants découvrent bientôt qu'ils peuvent trouver ensemble des solutions créatives aux problèmes les plus inattendus en mettant leurs passions en commun… Sous ce titre: le jeune garçon est extrêmement flatté de servir d'assistant au professeur Molécule, qui est venu présenter les différentes étapes de la méthode scientifique à sa classe. À la fin de la journée, le héros décide d'essayer chez lui une expérience que leur a proposée leur visiteur. Or, en remplaçant de manière totalement irresponsable et imprudente la levure alimentaire (qu'il ne trouvait pas) par de mystérieux granulés blancs trouvés dans le garage, Philémon provoque une terrible explosion et se retrouve métamorphosé en rat! Alors qu'il fuit la maison, il est récupéré par Lili, qui sera d'une aide précieuse pour l'aider à retrouver sa forme humaine…